傳統(tǒng)的農(nóng)家肥就是由糞便和秸稈漚肥發(fā)酵而成。但是由于發(fā)酵周期較長，常常需要幾個月的時間去堆積，且肥料較化肥來說速度緩慢。所以造成了化肥施用過量，導致土壤板結(jié)和鹽漬化。但有機肥料（也就是完全腐熟的農(nóng)家肥）卻可以很好的改善土壤結(jié)構(gòu)，增加土壤有機質(zhì)，所以有機肥的肥效利用以及發(fā)酵生產(chǎn)周期一直是個問題。
現(xiàn)在隨著科技的發(fā)展，一些可以促進發(fā)酵進程的菌種被研發(fā)出來，還能達到除臭的效果。一些賣發(fā)酵菌種的廠家，都會告訴我們，他的菌種腐熟迅速，然而實際上都有些過于夸張。有機肥設(shè)備生產(chǎn)廠家告訴我們，發(fā)酵主要分為兩個階段：
1.高溫階段：
添加菌種，除臭、打破菌細胞，殺滅糞便以及秸稈中的病原菌、蟲卵以及雜草種子等等；增加發(fā)酵的起始溫度，在48小時內(nèi)即可升溫至55℃以上；臭味逐漸消失，病蟲草害種子等紛紛死去，幾天后產(chǎn)生白色菌絲并布滿表面。
需注意的是：
整個發(fā)酵屬于好氧發(fā)酵，然而堆肥發(fā)酵主要是以堆肥升溫為主，所以堆體內(nèi)的氧氣會逐漸減少，同時溫度過高會導致發(fā)酵時產(chǎn)生的有益菌失活，從而導致發(fā)酵緩慢甚至停止發(fā)酵。
2.中低溫階段：
經(jīng)過前期的腐熟，下一部就是分解：主要是將糞便以及秸稈中的高分子有機質(zhì)，分解為小分子物質(zhì)。這樣才有利于土壤的吸收和利用，更有利縮短施肥的肥效釋放時間。此階段需要7~10天左右的時間，發(fā)酵溫度基本在30~45℃，所以又成為中低溫階段。
需注意的是：
此階段不可省略，因為后期將小分子分解出來，才會不再臭味復(fù)發(fā)；同時，有機肥施肥效果緩慢，高分子的有機質(zhì)會增加土壤的分解能力，無法及時的緩解土壤板結(jié)、鹽漬化等問題嚴重的地區(qū)。
每年我國生產(chǎn)大量的畜禽糞便，但是因為環(huán)保意識不到位，38億噸左右的糞便，有一半以上的糞便污水以及生活污水，直接排到了田間、河水中，不僅污染當?shù)貧夂颦h(huán)境，還影響人們的日常生活。再加上每年的秸稈產(chǎn)生量能達到9億多噸，而利用率也不到五成左右，每年秸稈焚燒屢禁不止，對環(huán)境也是一種污染。
這些糞便和秸稈資源，對于環(huán)境是一種污染，對于農(nóng)業(yè)生產(chǎn)卻是寶貴的有機肥肥料來源。近兩年來，政府也相繼出臺了各種有關(guān)于養(yǎng)殖廠禽畜糞便無害化處理的規(guī)范標準，對于符合標準的有機肥生產(chǎn)設(shè)備可申請補貼。
